SnapGene 是一款强大的多功能的分子生物学工具,能够非常直观的注释分析和DNA图谱,用于创建和共享丰富的注释文件,帮助用户准确清晰地为分子生物学绘制相关图形,生物相关专业的用户不要错过!
SnapGene可帮助用户快速计划,可视化和记录您的日常分析生物学程序,并为大家提供更安全快速的方法,现在每个DNA构建体都可以用丰富的电子格式记录,它节省了大量的时间和金钱,并且方便使用者快速发现问题,制作更加优化的决策和方案,软件界面友好,使用简单,记录全面,是一个非常理想的工具。
厂商名称:SnapGene
产品简介 相关产品 厂商介绍
功能
01-DNA可视化:查看DNA序列的多个视图
· 地图:自定义,酶位点,引物,ORF,DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式
序列:使用双链模式查看酶位点,具有翻译,引物和DNA颜色。单链模式显示具有彩色的紧凑概览
· 酶:从一系列酶组中选择。剪切网站可以显示为数字或行,按名称或频率排序
· 功能:按名称、位置、大小、颜色,方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或展开的显示之间的切换。
· 引物:按名称、位置、大小、颜色、方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或展开的显示之间的切换。
· 历史:查看DNA构建体的自动生成的图形历史记录。
02-大序列:浏览染色体大小序列
· 查看:利用SnapGene的数据处理功能,扫描具有数千个带注释功能的大型DNA序列
· 搜索:使用的MICA算法即时在染色体内找到序列
· 缩放:使用多功能控件调整缩放系数和显示区域
03-蛋白质可视化:查看蛋白质序列的多个视图
· 地图:自定义区域、站点、键和序列颜色的显示
· 系列:使用具有相关功能的1或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列
· 属型:查看蛋白质的分子量,消光系数,等电点和氨基酸组成。可以对蛋白质的选定部分进行相同的分析
· 属性:按名字、位置、大小、颜色或类型对带注释的功能列表进行排序。复选框在紧凑或展开的显示之间的切换
· 历史:查看自动生成的蛋白质序列图形历史记录。蛋白质或DNA序列可以作为单独的文件再生
04-直观的序列编辑:编辑DNA和蛋白质序列
· 标准编辑:进行插入、删除、替换和大小更改。复制并粘贴序列时,会自动传输功能
· DNA结束:编辑线性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯
05-序列颜色编码:将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一
· 给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见
06-属性注释:自动注释常用功能,或手动注释新颖功能
· 自动检测:使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中您选择的功能可以添加到自定义数据库中
· 手动注释:选择DNA或蛋白质序列的一部分,并使用的GenBank兼容空间注释
模拟
SnapGene提供优雅、信息的窗口,用于模拟常见的克隆换个PCR方法
限制性站点指标:确认限制性网站适合克隆
· 属性:以粗体显示的限制性位点或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组
· 甲基化敏感性:限制性位点被Dam , Dcm或EcoKI甲基化阻断。SnapGene将自动用星号标记该站点
· 性质:利用工具提示来避免有问题的限制网站
限制性克隆:可视化克隆过程
§ 如果您已经准备好了过程,那么模拟需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,则可以捕获并纠正错误。
聚合酶链反应:模拟标准PCR
§ 使用您自己的引物,或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录上存储模板和引物。
重叠延伸PCR:通过重叠延伸PCR融合片段
§ 组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向,SnapGene将设计引物。
引物定向诱变:使用诱变隐去进行定点诱变
§ 选择诱变引物,然后按按钮以查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。
网关®克隆:模拟网关®BP克隆或LR克隆,或两者在同一时间
§ 为了方便起见,提供了公共的供体向量和目的向量。选择要组装的片段,Snap Gene将设计引物。
Gibson组装
通过融合八个片段或通过将八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种克隆方法。
§ 选择要融合的片段及其方向,Snap Gene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
IN-FUSION®克隆
通过将八个片段插入载体来模拟Clontech的In-Fusion克隆。融合克隆是创建基因融的一种通用的方法。
§ 选择要融合的片段及其方向,Snap Gene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反方向PCR产生。
TA和GC克隆:通过TA或GC克隆捕获PCR产物
选择常规TA克隆或高校GC克隆
§ 为了方便起见,通过了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
退火寡核苷酸:将两个寡核苷酸退火以形成双链产物
§ 使用的控件添加突出端以进行限制性克隆。
避免错误
使用SnapGene的结构是正确的,并确认已获得的序列。
基因融合阅读框:构造中的翻框架中。
§ 链接的翻译
使用“序列”视图可以查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果这样,翻译将链接在同一行上。如果不是,则翻译在单独的行上。
与参考序列比对:使用功能的对齐工具检查实际结构是否与模拟结构匹配。
§ 映射概述
查看比对序列与参考序列匹配的地方以及存在差异的概述。
§ 序列详细信息
自动记录
SnapGene自动记录操作以创建图形历史记录,并将原型构造在文件中。
“撤销”功能:撤销几何操作。
尝试SnapGene文件而感到—重复步骤。
历史和原型:查看构造的图形历史记录
单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
在历史树中单击原型,以重新生成该原型序列文件,其注释和克隆历史记录。
历史颜色
使用可选的历史记录颜色来标识序列的更改
查看有关组装结构的详细信息,结扎的粘性末端。
拥有您的数据
SnapGene使您可以选择读取和共享文件,同时保持对数据的控制。
安全文件管理
将SnapGene文件保存在的位置。
使用计算机上熟悉的安全操作系统来存储和组织SnapGene文件
从格式导入
读取常见的文件格式
导入DNA序列,还导入注释。将继续开发进口商,以您不会被锁定的文件格式。
导出为标准格式
将序列,图谱或凝胶图像转换为标准格式。将地图或模拟的穷糖凝胶导出为常见的图像格式。
与SnapGene Viewer共享数据
需将文件和链接发送到SnapGene Viewer。就像的SnapGene界面一样,收件人将能够看到图,序列和注释。
SnapGene 6.1为克隆和可视化提供了新功能:亮点包括在模拟Golden Gate Assembly时简化的引物设计、用于ssRNA序列的新二级结构视图,以及在全部操作系统中支持黑暗模式。
Golden Gate Assembly使用新工具模拟Golden Gate Assembly,可以自动设计Golden Gate Assembly的引物和悬垂,优化反应保真度,以很大程度的提高成功的可能性。
RNA二级结构
使用新的二级结构视图可视化您的单链RNA序列如何折叠,该视图显示由ViennaRNA Package计算的理想结构。
深色模式
SnapGene用户界面现在支持黑暗模式。默认情况下,将与您的黑暗或光明模式操作系统设置相匹配。
导出的选项
使用选项中的新导出面板自定义如何将内容导出到GenBank,包括LOCUS字段标识功能导出选项。
支持Apple Silicon
SnapGene现在可以在装有M1芯片的Apple电脑上运行。
系统操作要求:
Windows 7或更高版本(64位只适用于Intel,SnapGene 5.1或更高版本)
macOS 10.11(SnapGene 5.2.5或更早版本)
macOS 10.12或更高版本(SnapGene 6.0.0或更高版本)
Fedora Linux 21或更高版本
Red Hat (包括CentOS)Linux 7.2或更高版本(SnapGene 5.2.2或更高版本)
Ubuntu Linux 18.04或更早的LTS版本(SnapGene 5.3.3或更早版本)
Ubuntu Linux 20.04(SnapGene 6.0.0或更高版本)
硬件要求:
内存:1GB以上
硬盘:250MB可用磁盘空间
显示:分辨率1440×900或分辨率
图片 | 产品名称 | 分类 | 厂商 |
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Panopticon | 数据可视化 | Altair |
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Ipswitch MOVEit | 数据可视化 | Ipswitch, Inc |
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F.A.S.T RTA | 数据可视化 | Fekete Associates Inc. |
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EnergyPro | 数据可视化 | EMD International A/S |
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WindPro | 数据可视化 | EMD International A/S |
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EEcoMark | 数据可视化 | BAPCo |
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Windographer | 数据可视化 | Mistaya Engineering |
SnapGene 是一款强大的多功能的分子生物学工具,能够非常直观的注释分析和DNA图谱,用于创建和共享丰富的注释文件,帮助用户准确清晰地为分子生物学绘制相关图形,生物相关专业的用户不要错过!
SnapGene可帮助用户快速计划,可视化和记录您的日常分析生物学程序,并为大家提供更安全快速的方法,现在每个DNA构建体都可以用丰富的电子格式记录,它节省了大量的时间和金钱,并且方便使用者快速发现问题,制作更加优化的决策和方案,软件界面友好,使用简单,记录全面,是一个非常理想的工具。